質問

エージェントライセンスを付与されたユーザーに対して、ある特定のプロジェクトでのコメントは内部コメントだけに制御することはできますか。

回答

エージェントライセンスを付与されたユーザーでも、「プロジェクト設定＞権限＞サービスデスクエージェント」で権限が付与されていなければ内部コメントしかコメントできません。

プロジェクトごとに「サービスデスクエージェント」権限を付与するか、または外すかで制御することは可能かと思われます。